2024年12月– date –
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RDKitのatom indexをcanonicalに振り直す方法[Tips]
【目的】 atom indexを一意に振り直す方法を解説する CanonicalRankAtomsやRenumberAtoms関数を理解する 【はじめに】 さまざまなデータベースから分子構造を入手したり自分でMolオブジェクトを作成していると、同じ分子においてもatom indexの順番が異な... -
RDKitでatom indexなどの好きな情報を分子構造と一緒に表示する方法[Tips]
【目的】 Molオブジェクトを描写するときに、atom indexなどの好きな情報を一緒に表示する方法をまとめる atomLabel, atomNote, molAtomMapNumber プロパティの違いを理解する 【コード】 RDKitのatom propertyにatomLabel, atomNote, molAtomMapNumberが...
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